多囊肾病PCR基因芯片可以同时检测和终末期肾脏疾病肾囊肿生长相关的84个重点基因的表达。多囊肾疾病（PKDS）代表一大群肾脏囊性扩张的病征，一般包含进行性肾功能障碍，渐进式的肾脏肿大，甚至肾功能不全等。最常见的PKDS是由继承常染色体显性遗传或常染色体隐性遗传导致的。关于常染色体显性遗传和隐性PKDS的研究表明其分子机制集中在囊肿生成，包括纤毛异常和细胞内钙离子失调，最终导致细胞过度增殖，凋亡，和去分化等。最新的研究进展集中在与肾囊肿生成和功能障碍相关的信号分子（如cAMP，钙，integrins，骨形态发生蛋白），以及血管生成，分化，有丝分裂因子方向。该芯片涉及的基因包括有丝分裂，血管生成，炎症反应和钙信号应激因素，初级纤毛的功能相关基因，以及这些相关基因的转录调控基因。利用实时定量PCR，研究者可以方便并且可信地对多囊肾病的相关基因进行同时检测。
Angiogenic Factors: EDN1, NRP2, TPM1, VEGFA, IL8. Apoptosis: BCL2L1, DAPL1. BMP/TGFb/Activin Signaling: BMP2, BMP4, BMP7, GREM1, NOG, WNT11. Calcium Signaling: PKD1, PKD2, SLC26A7, SLC2A9, SLC5A10. cAMP Signaling: ACY1, ADCY2, ADCY3, PTGER2, PTGER3, PTGS2, ADCY7, CREBBP, P2RX7. Nephron Segment Differentiation: ANGPT2, APOE, APOM. Integrin Signaling: CLDN10, CLU, COL12A1, COL3A1, FBLN1, FN1, PCDH7, RHOA, ITGA8, SPRY1. Growth Factor-Receptor Interaction: EGR3, FGF1, FGFR3, IGF1R, NTRK3, TGFB3. Immune/Inflammatory Pathways: CFD, CXCL1, CYP8B1, IL17D, IL6, KNG1, NRG1, PCK1, PRLR, PTPRZ1, IL8. mTOR pathway: PIK3CA, PIK3R1. Primary Cilia: CYS1, DNAH5, IFT88, LGALS3, PDGFRA, PKHD1, TMEM27, UMOD, GLI2. Transcription Factors: FOSB, JUN, GLI2, WT1. Other Genes: AGXT2, ALDH8A1, CLCNKA, DPEP1, HGD, HRG, HSD11B2, MIOX, NAPSA, OSR2, PRKCB, RET, SCN5A, VGLL3