北京蛋白质组研究中心功能蛋白质组研究技术平台位于环境优美的中关村生命科学园内，是蛋白质组学国家重点实验室及国际人类肝脏蛋白质组计划（HLPP）表达谱和修饰谱项目的实施平台之一，相继在蛋白质组学方面承担了一系列国家973、863、自然科学基金及北京市重大项目等课题。平台可承接单项的蛋白质组学技术服务, 同时平台也开展规模化、高通量的蛋白质组学委托科研服务。服务项目包括样本制备、双向电泳、图像分析、胶内酶切、蛋白质鉴定、数据库查询与结果分析、免疫印迹及磷酸化蛋白质检测等。2010年新增细胞表面蛋白选择性标记技术、蓝色温和胶电泳系统分离蛋白质复合体、稳定同位素标记及免疫组化四项技术服务新项目。

北京蛋白质组研究中心功能蛋白质组研究技术平台已形成规模化，全方位的蛋白质组技术平台。

è     重点技术服务项目

è     Services

蛋白质组学样本制备

Proteomic sample preparation

差异荧光凝胶电泳（DIGE）

2-D Fluorescence Difference Gel Electrophoresis

细胞表面蛋白选择性标记技术 (新增)

DIGE Cell Surface Protein Labelling （New）

图像分析

Image analysis

胶内酶切

In-gel digestion

蛋白质鉴定

Protein identification

蓝色温和胶电泳系统分离蛋白质复合体(新增)

2-D Blue native gel for protein complex separation （New）

稳定同位素标记技术（SILAC）(新增)

Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture（New）

磷酸化蛋白质检测

Phosphorylated proteins detection

免疫印迹

Immunohistochemistry

免疫组化(新增)

Immunoblotting （New）

一、   样品制备技术

1．适于双向电泳的蛋白质提取及定量。

2．亚细胞器提取及纯度评价（质膜、线粒体、内质网、细胞核、胞浆）。

3．Beckman公司Optima™ L-80 XP超速离心机。

4．Beckman公司Avanti™ J-25高速离心机。

二、电泳及电转系统

          1. BIO-RAD公司PROTEAN IEF Cell等电聚焦仪。
2. BIO-RAD公司PROTEAN II xi Cell电泳槽。
3．BIO-RAD公司Mini-PROTEAN 3 Electrophoresis Module/Mini Trans-Blot Module。
4．Amersham pharmcia Biotech公司IPGphor等电聚焦仪。
5．Amersham pharmcia Biotech公司Ettan DALT II System。
6．Amersham pharmcia Biotech公司Hoefet miniVE electrophoresis and electrotransfer Unit。
7.图像分析软件BIO-RAD公司PDQuest™ 2-D analysis software version:7.11。
8.图像分析软件Amersham pharmcia Biotech公司Image Master™ 2D version:5.0。
9．自动切胶酶解系统为BIO-RAD公司Spot Cutter；WATERS公司MassPrep。
10．Amersham pharmcia Biotech公司Spot Handling Workstation。

三、蛋白质组学中的核心质谱技术

       基质辅助激光解析电离飞行时间质谱MALDI-TOF/TOF 4800（ABI公司）： 能从一个样品的PMF图谱中直接选择肽段离子进行片断化和MS/MS分析，而且分析可在数秒或数十秒内完成。该仪器是目前进行高灵敏度、高通量的蛋白质组分析非常理想的仪器。质量范围50-250KDa；分辨率：20000；准确度：＜50ppm

       电喷雾四极杆飞行时间串联质谱仪ESI-Q-TOF-MS（WATERS公司）:自动化的LC-MS/MS肽段测序功能，是多肽组学研究的重要技术。样品用量少，仅fmol样品就可测序（如电泳胶）。扫描质量范围5-3000Da,分辨率15000

       离子阱串联质谱仪ESI-Ion Trap-MS （Thermo公司）：中心具有两台离子肼串联质谱仪（LCQ； LTQ各一台），高通量LC-MS/MS肽段测序功能，为SHOTGUN技术首选串联质谱。

       中心最新引进的Finnigan LTQ-FT线性离子阱回旋共振质谱仪，是目前国际上蛋白质鉴定准确性最高的仪器之一，主要特点1.超高分辨率；2.精确质量数和多级串连质谱分析数据，分辨率50万,准确度1ppm，现已投入使用。

四、培训及送样须知

       平台可承接课题的技术服务。来人在本平台进修，学习。
       送样品可为冻干粉、溶液或胶内蛋白质（必须为考染），冻干粉、溶液应无盐。样品如有毒性或腐蚀性或需特殊保存的样品，请事先说明。

五、联系方式

      单位：北京蛋白质组研究中心

地址：北京市昌平区科学园路33号

邮政编码：102206

联系人：姜颖      魏汉东　

电话: 010-80705299   010-80705889

010-80727777转1126、1144

传真: 010-80705002、010-80705155
Email: jiangying304@hotmail.com; weihd@163.com

帐 号：0200004909200041055
户 名：北京蛋白质组研究中心
银 行：北京市工商银行永定路支行

六、近期发表的相关文章

1、Zhang X, Yang J, Guo Y, Ye H, Yu C, Xu C, Xu L, Wu S, Sun W, Wei H, Gao X, Zhu Y, Qian X, Jiang Y, Li Y, He F. Functional proteomic analysis of nonalcoholic fatty liver disease in rat models: ECHS1 down-regulation exacerbate hepatic steatosis. Hepatology. 2010, in press (IF 11.3)

2、Liu K, Qian L, Li W, Deng X, Chen X, Sun W, Wei H, Qian X, Jiang Y, He F. Two-dimensional blue native/SDS PAGE analysis reveals HSPs chaperone machinery involved in HBV production in HepG2.2.15 cells. Mol Cell Proteomics. 2009,8:495-505. (IF 8.834)

3、Sun W, Xing B, Sun Y, Du X, Lu M, Hao C, Lu Z, Mi W, Wu S, Wei H, Gao X, Zhu Y, Jiang Y, Qian X, He F. Proteome analysis of hepatocellular carcinoma by two-dimensional difference gel electrophoresis: novel protein markers in hepatocellular carcinoma tissues. Mol Cell Proteomics. 2007,6:1798-808. (IF 9.425)

4、Ying W, Jiang Y, Guo L, et al. A Dataset of Human Fetal Liver Proteome Identified by Subcellular Fractionation and Multiple Protein Separation and Identification Technology. Mol Cell Proteomics. 2006,5:1703-7. (IF 9.62)

5、Jiang Y, Ying W, Wu S, , et al. First insight into human liver proteome from PROTEOMESKY-LIVERHu ^1.0, a publicly-available database. J Proteome Res. 2010, 9: 79-94. (IF 5.684)

6、Sun A, Jiang Y, Wang X, Liu Q, Zhong F, He Q, Guan W, Li H, Sun Y, Shi L, Yu H, Yang D, Xu Y, Song Y, Tong W, Li D, Lin CL, Hao Y, Geng C, Yun D, Zhang X, Yuan X, Chen P, Zhu Y, Li Y, Liang S, Zhao XH, Liu S, He F. Liverbase: a comprehensive view of human liver biology. J Proteome Res. 2010, 9: 50-8. (IF 5.684)

7、Sun A, Zhang J, Wang C, Yang D, Wei H, Zhu Y, Jiang Y, He F. Modified Spectral Count Index (mSCI) for Estimation of Protein Abundance by Protein Relative Identification Possibility (RIPpro): A New Proteomic Technological Parameter. J Proteome Res. 2009, 8: 4934-42.  (IF 5.684)

8、Guo Y, Zhang X, Huang J, ZengY, Liu W, Geng C, Li KW, Yang D, Wu S, Wei H, Han Z, Qian X, Jiang Y, He F. The molecular hinge for regulation of hepatogenesis and hematopoiesis in mouse fetal liver explored with transcriptomic and proteomic approaches. Plos One. 2009, 4(10): e7641. doi:10.1371/journal.pone.0007641

9、Deng X, Li W, Chen N, Sun Y, Wei H, Jiang Y, He F. Exploring the priming mechanism of liver regeneration: proteins and protein complexes. Proteomics. 2009,9:2202-16. (IF4.586)

10、            Chen N,  Sun W, Deng X, Hao Y, Chen X, Xing B, Jia W, Ma J,  Wei H, Zhu Y, Qian X, Jiang Y*, He F. Quantitative proteome analysis of HCC cell lines with different metastatic potentials by SILAC. Proteomics 2008, 8: 5108-18. (IF4.586)