前列腺癌PCR基因芯片可以同时检测与前列腺癌的发展相关的84个关键基因的表达。前列腺癌在美国是致命性最高的癌症之一，主要表现为50岁以后的男性生殖腺的肿瘤。前列腺癌的分子病因目前还不清楚，但往往与雄激素信号和异常代谢的大分子物质（如脂肪酸）调节失控有关。事实上，雄激素消融治疗会引起原发性和转移性雄激素非依赖性前列腺癌的复发。截止目前，雄激素受体的表达会促进前列腺癌细胞的生存；而抑制雄激素受体的临床效果远低于预测。多不饱和脂肪酸会加速前列腺肿瘤的进展、增加死亡率，然而饮食中丰富的omega-3脂肪酸则前列腺癌患者有益。关于这些相关途径的研究可能会有助于我们更深入的理解前列腺肿瘤发生的分子机制。该芯片包括雄激素受体，PI3K/AKT和PTEN的信号通路基因，细胞周期和细胞凋亡通路相关的基因，前列腺癌检测的常规基因，以及对前列腺癌样本进行高通量芯片筛选出的一些重要基因。由于前列腺癌往往会有迁移的情况，因此该芯片同样包括肿瘤转移相关的基因。利用实时定量PCR，研究者可以方便并且可信地对前列腺癌症相关基因进行同时检测。
Differentially Methylated Promoters: APC, AR, CAV1, CCNA1, CDH1 (E-cadherin), CDKN2A, DKK3, DLC1, EDNRB, GPX3, GSTP1, MGMT (AGT), MSX1, PDLIM4 (RIL), PTGS2 (COX2), RARB, RASSF1, SFRP1, SLC5A8, TIMP2, TNFRSF10D, ZNF185. Up-Regulated in Prostate Cancer: ARNTL, CAMSAP1, DDX11, ECT2, ETV1, HAL, IGFBP5, KLK3, MTO1, PDPK1, RBM39, SOCS3, SOX4, SUPT7L. Down-Regulated in Prostate Cancer: CCND2, CLN3, GCA, IGF1, LGALS4, LOXL1, PPP2R1B, SFRP1, SLC5A8, TFPI2, USP5. Metastatic Potential: CREB1, KLHL13, MAX, NDRG3, PES1, SEPT7, SCAF11 (SFRS2IP). Androgen Signaling: AR, CAV1, CCND1, DAXX, EGFR, FOXO1, GNRH1, IGF1, IL6, NFKB1, NRIP1, PTEN, SHBG, TGFB1I1, TIMP2, TIMP3, VEGFA. PI3K/AKT Signaling: AKT1, AR, BCL2, CCND1, CCND2, CDH1 (E-cadherin), CDKN2A (p16INK4), EGFR, FOXO1, GNRH1, IGF1, IL6, MAPK1 (ERK2), NFKB1, PDPK1, PTEN, TIMP2, TIMP3, TNFRSF10D, TP53, VEGFA. PTEN Signaling: AKT1, EGFR, GNRH1, IGF1, IL6, MAPK1 (ERK2), PDPK1, PTEN, TIMP2, TIMP3, TP53, VEGFA. Apoptosis: BCL2, CASP3, CDKN2A (p16INK1), EGFR, ETV1, GNRH1, IGF1, IL6, MAPK1, NFKB1, PTEN, TIMP2, TIMP3, TP53, VEGFA. Cell Cycle: APC, BCL2, CASP3, CAV2, CCNA1, CCND1, CCND2, CDKN2A (p16INK4), EGFR, IGF1, PPP2R1B, PTEN, PTGS1, PTGS2 (COX2), TP53. Transcription Factors: AR, ARNTL, CDKN2A (p16INK4), CREB1, DAXX, EGR3, ERG, ETV1, FOXO1, MAX, MSX1, NFKB1, NKX3-1, NRIP1, RARB, RBM39, SOX4, SREBF1, SUPT7L, TP53. Fatty Acid Metabolism: ACACA, CAMKK1, FASN, HMGCR, IGF1, PRKAB1, SREBF1, STK11 (LKB1). Others: MKI67, TMPRSS2.