2013年9月12日,全球最大基因学研究机构华大基因的子公司——深圳华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)与南德克萨斯START公司(South Texas Accelerated Research Therapeutics)正式宣布双方将联合开展及推进圣安东尼奥千人癌症基因组项目(San Antonio 1000 Cancer Genome Project,SA1kCGP)。该项目开创性地将遗传变异与临床表征相结合,将进一步促进药物特异性标记的个性化医疗发展。SA1kCGP的项目资金完全由私人捐赠,研究中所获得的10种常见癌症的全基因组数据将全部向全球科研人员免费公开。
圣安东尼奥千人癌症基因组项目目前正开展对一种癌症的1000多个患者所采集的癌症组织、正常组织和血液样本进行全基因组测序,其计划最终完成10种癌症的10,000个患者的基因组测序工作。在本次合作中,华大科技将负责通过新一代高通量测序和信息分析技术来鉴定与特定癌症相关的基因突变,并将所获得的所有遗传及临床数据收集、分析及整合到华大基因的资源中。作为SA1kCGP项目发起方——START将负责患者招募,肿瘤样本采集和临床患者资料收集等工作。
相比于其它癌症研究项目而言,SA1kCGP的特殊性在于其将基因组数据直接与临床信息结合,这些数据包括由电子医疗记录和专有软件技术所存档的数据,这使研究人员可以更好地了解遗传变异与临床表征之间的相关性。单从缺乏临床信息的其它癌症项目中获取数据是不可能得到这些结果的。癌症基因组计划(TCGA)是由美国国立卫生研究院投资的一个癌症基因组研究项目,其资金超过3.75亿美元。
“我们很高兴能够与START携手开展这个极其重要的多种癌症基因组研究项目。”华大科技执行总裁李英睿表示:“基于START世界一流的科研团队、Tony Tolcher博士的带领以及项目的规模,我们期待SA1kCGP能进一步开拓癌症诊断治疗新方法。SA1kCGP 虽然作为一个私人资助的项目,却旨在产生相关的、有用的和可利用的癌症临床基因组数据,以有利于个性化癌症治疗发展。”
“能够与拥有强大测序技术、丰富生物信息分析经验、巨大生产能力的华大科技合作,这无疑将会使SA1kCGP项目上升到一个全新的高度。”START执行总裁Anthony W. Tolcher博士指出:“作为一个私人资助的科研项目,SA1kCGP依托于所有捐赠者的承诺及共同愿景,以及华大科技举足轻重的作用,这使我们能够进一步估量SA1kCGP能为癌症患者所能带来的潜在利益。”
发起于2012年的SA1kCGP项目,已经超过了其原本设定的收集1000例样本的目标。截止到目前为止,已经有1200名患者同意提供癌症组织样本,并且也同意将他们的肿瘤细胞移植到小鼠中进行靶向基因突变研究,以作为药物开发之用。SA1kCGP 计划以低成本完成10000个样本的测序及研究工作,这笔费用预计只占以往癌症研究项目费用的一小部分。目前,SA1kCGP项目的总预算为500万美元,其中约100万美元来自捐赠。
SA1kCGP拥有世界一流的项目团队,其主要由200多位来自圣安东尼奥当地医院的癌症外科医生、病理学家、研究员和肿瘤学家组成。其中大部分当地医院拥有90%的癌症护理和临床研究。这些医院招募癌症患者参加SA1kCGP项目,并负责收集供测序和分析使用的组织样本。通过这个社区网络,可以避免转诊信息出现偏差。患病群体将成为地区内癌症患者的典型代表。这将保证产生足够多的数据,然后通过算法解释癌症的致病原因。
以往研究都是使用福尔马林保存了30年的样本,而本研究中,血液学和肿瘤学的科研人员决定采用新鲜组织样本进行测序和分析。如何获取和运输新鲜组织样本是最主要的障碍,不过START已经与社区治疗中心达成一致,这些中心覆盖了90%的癌症护理工作。本项目除了会对组织样本进行DNA测序以外,还将会进行RNA和蛋白质组学研究分析,以便能够为肿瘤研究和新型抗癌药物的开发提供更全面的信息。
非盈利性慈善基金组织——Thrivewell癌症基金会负责为SA1kCGP收集和管理捐赠资金,其目前正在筹集其他的私人捐款。如果您也想支持SA1kCGP项目,可访问www.thrivewell.org了解更多详情。
关于START:
START是一个全球性的研究机构,主要致力于提高癌症患者的生活质量,延长癌症患者的寿命的新型抗癌药的研究。由Anthony W. Tolcher博士,Amita Patnaik博士和Kyriakos P. Papadopoulos博士等组成的管理层组建了一批高素质的人才队伍。
欲了解更多资讯关于START,请点击:
www.startthecure.com/news_detail.php?uid=82
关于Thrivewell癌症基金会:
Thrivewell癌症基金会通过资助癌症研究试图找出癌症的治愈方法,并提供对癌症病人的支持以及开展相关的活动来提高癌症病人及其家人的生活质量。更多信息,可访问:www.thrivewell.org。